ЦСК використовує у своїй роботі БД ЦСК, яка зберігає дані про:
- Сертифікати.
- Запити на сертифікати.
- Запити на відкликання та відновлення.
- Списках відкликаних сертифікатів.
На даний момент підтримується робота БД ЦСК під управлінням СУБД Firebird (free open-souce).